Apa itu prolin : Pengertian prolin
Prolin adalah asam amino nonesensial dalam tubuh manusia. Prolin memiliki tiga bentuk: DL-prolin, L-prolin, dan D-prolin. Prolin yang biasa disebut adalah L-prolin, asam amino alami yang berbentuk kristal kolumnar pada suhu kamar. Dengan cepat terurai pada suhu 215-220 derajat saat dipanaskan. Larut dalam air panas dan etanol, memiliki rasa agak manis, dan bersifat higroskopis. Ia berputar ke kiri dalam larutan basa. [ ]D25-86.5 derajat (air), -60.4 derajat (asam klorida 5N). Itu ditemukan di berbagai protein. Ini adalah asam amino yang cukup melimpah pada organisme planktonik laut dan juga terdapat dalam air laut, partikel, dan sedimen laut.
Apa itu prolin: Sifat struktur protein
Struktur siklik unik dari rantai samping prolin memberikan kekakuan konformasi prolin yang sangat baik dibandingkan dengan asam amino lainnya. Hal ini juga mempengaruhi laju pembentukan ikatan peptida antara prolin dan asam amino lainnya. Ketika prolin terikat pada gugus amino dalam ikatan peptida, nitrogennya tidak terikat pada hidrogen apa pun, yang berarti prolin tidak dapat menyumbangkan ikatan hidrogen tetapi dapat menerima ikatan hidrogen.
Pembentukan ikatan peptida dengan Pro-tRNAPro yang masuk jauh lebih lambat dibandingkan dengan tRNA lainnya, yang merupakan ciri umum asam amino N-alkil. Pembentukan ikatan peptida antara tRNA yang masuk dan rantai yang berakhir pada prolin juga berlangsung lambat. Pembentukan ikatan prolin-prolin paling lambat.
Kekakuan konformasi prolin yang unik mempengaruhi struktur sekunder protein di dekat residu prolin dan mungkin menjelaskan prevalensi prolin yang lebih tinggi pada protein bakteri termofilik. Struktur sekunder protein dapat digambarkan dengan sudut dihedral φ, ψ, dan ω dari tulang punggung protein. Struktur siklik rantai samping prolin mengunci sudut φ pada sekitar -65 derajat .
Prolin dapat bertindak sebagai pengganggu struktural pada elemen struktur sekunder konvensional seperti -heliks dan -lembar; namun, prolin juga biasa ditemukan sebagai residu ke-x dalam -heliks dan di tepi -lembar. Bubuk prolin laktobasilus juga umum terjadi secara bergantian (struktur sekunder lainnya), membantu membentuk putaran. Hal ini mungkin menjelaskan fakta aneh bahwa prolin sering terkena pelarut meskipun memiliki rantai samping yang sepenuhnya nonpolar.
Prolin atau hidroksiprolin yang berurutan dapat menghasilkan heliks poliprolin, yang merupakan struktur sekunder utama dalam kolagen. Hidroksilasi prolin secara signifikan meningkatkan stabilitas konformasi kolagen oleh prolil hidroksilase. Oleh karena itu, hidroksilasi prolin adalah proses biokimia yang penting untuk mempertahankan jaringan ikat organisme tingkat tinggi. Penyakit parah seperti penyakit kudis mungkin disebabkan oleh cacat pada hidroksilasi ini, seperti mutasi prolil hidroksilase atau kurangnya kofaktor asam askorbat esensial (vitamin C).